Projekte

Die folgenden Projekte werden durch den Forschungsschwerpunkt gefördert:

Next Generation Sequencing: Big Data meets HPC

B. Schmidt, T. Hankeln, A. Hildebrandt, M Andrade, S. Gerber


Determination of cloud particle shapes from optical measurement techniques

A. Hildebrandt, R. Weigel, P. Spichtinger


Towards an SFB proposal on Deciphering cell identity and function using single-cell data analysis

M. Andrade, A. Hildebrandt


Experimental and computational investigation of the regulation of longevity genes

S. Gerber, K. Endres, M. Müller, M. Andrade, B. Schmidt, K. Zarnack


Small Data in Predictive Toxicology: Towards Automated Hypothesis Generation and Testing for Hepato- and Nephrotoxicity

M. Andrade, S. Kramer

 

 

Ausgelaufene Projekte:

Big Data in Radiology: Quantitative Assessment of 3D Computer Tomography Image Data Bases

A. Brinkmann, P. Mildenberger, D. Pinto dos Santos, E. Schömer, M. Wand (Medizin / Informatik)


Numerische Optimierung von Tensor-Netzwerken

T. Raasch, R Orús, M. Rizzi (Mathematik / Physik)


Effiziente und genaue Analyse von Metagenomischen DNA-Fragmenten auf GPU

B. Schmidt, T. Hankeln (Informatik / Biologie)


A novel method to solve large scale 3D inverse problems with application to continental collision

B. Kaus, M. Hanke-Bourgeois (Geowissenschaften / Mathematik)


Data Mining for Indoor and Outdoor Chemistry

Williams / Kramer (Atmosphärenchemie / Informatik)


TCGA Data Mining

Brinkmann / Castle / Kramer (Biologie / Genomics / Informatik)


Umfassende Erdsystem-Modelllierung während des Perms

Pozzer / Tost (Atmosphärenchemie / Meteorologie)


Graph-Grammatiken zur Molekularen Substruktursuche

Althaus / Brenk / Hildebrandt (Pharmazie / Informatik)


Rückwärtsmodellierung geologischer Strukturen anhand von synthetischen und Feldbeispielen

Kaus / Passchier (Geowissenschaften)


Evolution von Endothermie

Griebeler / Sfakianakis / Werner (Mathematik / Biologie)


Entwurf, Implementierung und Evaluierung eines neuen Ansatzes zur Bestimmung von somatischen Mutationen aus Short-Read Datensätzen

Schmidt / Brinkmann (Informatik)


Detektion und Visualisierung von wichtigen Strukturen in komplexen meteorologischen Strömungen

Schömer / Wirth (Informatik / Meteorologie)


Automatisierte Detektion von unintendierten Bewegungen in der Dentalen digitalen Volumentomographie (DVT)

Schulze / Schömer (Zahnmedizin / Informatik)


Verbesserung von Scoring-Funktionen und Behandlung der Protein-Flexibilität beim molekularen Docking an Hand von FabF als Modellsystem

Brenk / Hildebrandt (Pharmazie / Informatik)


Bayes'sche Parameteridentifikation und Unsicherheitsquantifizierung in der Systembiologie: Eine Studie anhand des Drosophila Gap Gene System

Hanke-Bourgeois / Legewie / Sfakianakis (Mathematik / Molekulare Biologie)


Strukturbildung in Wolken

Spichtinger / Hanke-Bourgeois / Hildebrandt (Meteorologie / Mathematik / Informatik)


Superparameterisierte Konvektion im Klimasystem

Tost / Spichtinger (Meteorologie)


Computergestützte Prognose chronischer Lebererkrankungen

Althaus / Hildebrandt (Informatik)


Optimierungsmethoden für Fragestellungen der Bioinformatik

Althaus (Informatik)


Numerisch exakte Quanten-Monte-Carlo Algorithmen für Störstellenprobleme

Blümer (Physik)


Entwicklung und Implementierung von Parallelisierungsverfahren für die mikroskaligen Klimamodelle ENVI-met und MISKAM

Bruse (Geowissenschaften)


Rekonstruktion von Trajektorien geladener Teilchen in Spurdetektoren mit Hilfe von Grafikkarten

Büscher / Schömer (Physik / Informatik)


3D Strukturaufklärung vom Skorpionhämocyanin mittels Röntgenkristallographie und bioinformatischen Methoden

Decker / Stöcker (Biologie)


Dynamik reversibel gebundener Wasserstoffbrückennetzwerke unter dem Einfluß externer Kräfte: Molekulardynamik-Simulationen Untersuchungen an Catenanstrukturen

Diezemann (Chemie)


Inverse Probleme bei Skalenübergängen in der Simulation von weicher Materie

Hanke-Bourgeois (Mathematik)


Tomographische Verfahren in heterogenen Medien

Hanke-Bourgeois / Paul (Mathematik / Physik)


Bioinformatische Anwendungen für Next Generation Sequencing

Hankeln / Zischler (Molekulargenetik / Anthropologie)


Next Generation Sequenziertechnologien und neue bioinformatische Auswertemethoden für die Genomforschung

Hankeln / Zischler (Molekulargenetik / Anthropologie)


Bedeutung von Rezeptorclustern für eine effiziente Oligomerisierung von porenbildenden Toxinen

Hellmann / Klenke (Biologie / Mathematik)


Homologie-Modellierung von großen Proteinkomplexen unter Berücksichtigung von Elektronendichtekarten

Jaenicke / Decker / Hildebrandt (Biophysik / Informatik)


Effiziente Behandlung von Nichtlinearitäten in großskaligen 3D Simulationen geodynamischer Prozesse

Kaus / Lukacova-Medvidova (Geowissenschaften / Mathematik)


Effektive Rekonstruktionsverfahren in der Elektronenkristallographie

Kolb / Raasch / Schömer (Physikalische Chemie / Mathematik / Informatik)


Neue Algorithmen für linear skalierende ab-initio Molekulardynamik

Kühne (Physikalische Chemie)


Numerische Untersuchung von Taxis-Diffusions-Reaktions-Gleichungen mit Anwendungen in der Modellierung von Krebs

Lukacova-Medvidova / Hellmann (Mathematik / Biologie)


Numerische Untersuchung von Chemotaxis und Chemokinesis

Lukacova-Medvidova / Hellmann (Mathematik / Biologie)


Adaptive Lange-Zeitschritt Finite Volumen Methoden für geophysikalische Strömungen

Lukacova-Medvidova / Wirth (Mathematik / Meteorologie)


Ligandenbasierte Verfeinerung eines atomaren Proteinmodels (BgAChBP) mit bioinformatischen Methoden

Markl / Hildebrandt (Biologie / Informatik)


Das Perkolationsproblem für Dispersionen kolloidaler Plättchen in Theorie und Simulation

Oettel (Physik)


Entmischungs- und Testteilchendynamik in Systemen weicher Materie

Oettel / Virnau (Physik)


Modellierung verzweigter Störungszonen in der Erdkruste

Passchier / Kaus (Geowissenschaften)


Interactive Digital Field Mapping

Passchier (Geowissenschaften)


3D Modellierung von Gesteinsmikrostrukturen mit Hilfe eines automatischen Gefügemikroskops

Peternell / Schömer (Geowissenschaften / Informatik)


Entwicklung eines vergröberten Modells zur Simulation von Wechselwirkungen zwischen Membranen und Proteinen, die Fibrillen bilden

Schmid / Hildebrandt (Physics / Computer Science)


Bioinformatische Werkzeuge zur Untersuchung der biologischen Funktion repetitiver DNA in Eukaryoten

Schmidt / Hankeln / Tiwari (Informatik / Molekulargenetik / Molekulare Biologie)


Entwurf, Implementierung und Evaluierung einer hoch sensitiven CUDA-basierten Methode für das Alignment von Hoch-Durchsatz DNA-Fragmenten auf Referenzgenome

Schmidt / Hankeln (Informatik / Biologie)


Kombination von physikalischen Algorithmen mit Methoden aus der Informatik zur Optimierung geometrischer Packprobleme

Schömer / Schneider (Informatik / Physik)


INSIGHT: Ein neuartiges Werkzeug zur Analyse und Visualizierung essentieller Strukturen in großen Ensembles von Wettervorhersagen

Schömer / Wernli (Informatik / Meteorologie)


Computer unterstützte Docking- und Mutagenese-Untersuchungen der Interaktionen vonAstacin-Proteasen und ihren natürlichen Hemmstoffen

Stöcker / Hildebrandt (Biologie / Informatik)


Simulationen jenseits des Tempolimits

Weigel / Schilling (Physik)


Simulation von Vektor-Spingläsern auf Grafikkarten

Weigel / Schömer (Physik / Informatik)


Numerical Calculations for LHC Physics

Weinzierl (Physik)


Simulation von Bannerwolken

Wirth (Meteorologie)